基于RT-PCR的RspCas13d系统的开发,用于检测猪三角型冠状病毒
Yu Zhao1, Tiejun Zhang1, Changyu Zhou1
1Animal Disease Prevention and Food Safety Key Laboratory of Sichuan Province, Key Laboratory of Bio-Resource and Eco-Environment of Ministry of Education, College of Life Sciences, Sichuan University, Chengdu, 610064, China.
Applied microbiology and biotechnology
|July 21, 2023
概括
使用基于RT-PCR的RSPCas13d系统的新诊断方法提供了高度敏感和特定的猪三角冠状病毒 (PDCoV) 检测. 这一进步有助于控制小猪的PDCoV感染.
科学领域:
- 兽医病毒学 兽医病毒学
- 分子诊断学 分子诊断
- 传染病研究 传染病研究
背景情况:
- 猪三角型冠状病毒 (PDCoV) 在小猪中引起显著的肠道疾病.
- 目前的诊断方法如qPCR缺乏PDCoV检测的最佳灵敏度.
- 有效的PDCoV诊断对于预防,控制和减轻跨物种传播风险至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证用于PDCoV检测的高度敏感和特定的诊断方法.
- 评估基于RT-PCR的RSPCas13d系统在临床样本中的PDCoV诊断的有效性.
- 建立一个可靠的分子工具来识别PDCoV感染.
主要方法:
- 使用逆转录-聚合酶链反应 (RT-PCR) 与RspCas13d检测系统相结合.
- 确定了开发的测试的检测极限.
- 通过对一组常见的猪病毒进行测试来评估特异性.
- 使用来自猪的临床样本验证了该方法.
主要成果:
- 基于RT-PCR的RspCas13d系统证明了低检测极限为4个副本/μL.
- 该试验没有显示与其他重要的猪病毒的交叉反应,包括PEDV,CSFV,PRV,PRRSV,TGEV和罗塔病毒.
- 该方法在临床猪样本上应用时被证明是有效和可靠的.
结论:
- 基于RT-PCR的RSPCas13d检测系统是PDCoV.的高度敏感和特定的分子诊断工具.
- 这种新的方法比PDCoV诊断的现有方法有了显著的改进.
- 作为诊断病毒基因组的候选人,特别是兽医环境中的PDCoV,RspCas13d显示出了希望.
