为了快速分析生物治疗性质谱数据,UniDec处理管道
Wilson Phung1, Corey E Bakalarski1, Trent B Hinkle1
1Microchemistry, Proteomics, and Lipidomics Department, Genentech, Inc., South San Francisco, California 94080, United States.
Analytical chemistry
|July 21, 2023
概括
UniDec处理管道 (UPP) 为生物治疗完整质谱 (MS) 数据提供了快速量化. 这种免费的开源软件能够有效地分析各种生物治疗应用的大型数据集.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 分析化学 分析化学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 原生和变质质谱 (MS) 对于生物治疗性质定性至关重要.
- 增加MS数据规模需要高效,高通量数据分析工作流程,以快速量化.
研究的目的:
- 引入UniDec处理管道 (UPP),这是一个新的工作流程,用于分析批量生物治疗完整的MS数据.
- 提供一个灵活和用户友好的平台,用于生物治疗特征的量化.
主要方法:
- UPP集成到UniDec软件包中,具有快速处理,解卷和峰值检测.
- 基于电子表格的界面允许用户输入数据文件名,解卷参数和量化设置.
- 管道处理分批数据,在电子表格和HTML报告中返回结果.
主要成果:
- 在双特异抗体数据中,UPP成功测量了正确的配对百分比.
- 管道准确地确定了抗体与药物合物的药物与抗体比率.
- 在处理各种生物治疗完整的MS数据集方面表现出灵活性.
结论:
- UPP提供了一种强大而有效的解决方案,用于大规模生物治疗性MS分析的量化.
- UPP的免费和开源性质促进了定制和在生物制药研究中更广泛的采用.
- UPP是一个多功能工具,适用于广泛的生物治疗特征化挑战.
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