基于原始唾液的COVID-19RT-LAMP诊断试验的准确性
Kátia Maria Dos Santos Cabral1, Ramon Cid Gismonti Baptista2, Terezinha Marta Pereira Pinto Castineiras3
1Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Instituto de Bioquímica Médica-Leopoldo de Meis, Rio de Janeiro, RJ, Brazil; Centro Nacional de Biologia Estrutural e Bioimagem, Plataforma Avançada de Biomoléculas, Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
概括
这项研究验证了使用唾液进行COVID-19诊断的反转录环介导同热放大 (RT-LAMP). RT-LAMP提供了一种快速,准确和少入侵的方法来跟踪大群体中的SARS-CoV-2病例.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 由于COVID-19的流行,需要快速的诊断方法来控制SARS-CoV-2的传播.
- 定量实时聚合酶连锁反应 (qRT-PCR) 是黄金标准,但在成本和周转时间方面存在局限性.
- 为了解决这些局限性,研究了包括抗原快速测试和RT-LAMP在内的替代诊断方法.
研究的目的:
- 验证使用逆转录-循环介导同热放大 (RT-LAMP) 在唾液样本中检测SARS-CoV-2.
- 为了比较RT-LAMP使用纯化RNA与原始唾液的诊断性能.
- 评估RT-LAMP作为广泛的COVID-19监测的快速,不那么侵入性的诊断工具的可行性.
主要方法:
- 通过RT-LAMP选择和验证五种用于检测SARS-CoV-2RNA的原料组.
- 使用度RT-LAMP分析117例患者样本,并与qRT-PCR结果进行比较.
- 用净化RNA和原始唾液样本评估RT-LAMP的性能.
主要成果:
- 通过ORF1-a和基因E原料的组合,与净化的唾液RNA实现了95.2%的灵敏度和90.5%的特异性.
- 使用原始唾液样本的RT-LAMP显示了可接受的准确性,灵敏度为81.8%,特异性为90.9%.
- 净化RNA的整体精度为92.9%,原始唾液的精度降至86.4%,表明直接样本的可行性.
结论:
- RT-LAMP是一种可行的,准确的方法来检测唾液中的SARS-CoV-2,它提供了一个不那么侵入性的替代性鼻拭子.
- 该试验即使使用原始唾液也表现出可接受的性能,简化了诊断过程并缩短了周转时间.
- 这种方法支持在大量人群中有效跟踪COVID-19病例,这对于持续的流行病管理至关重要.
