来自中国免疫缺陷患者的3型疫苗衍生的脊髓灰质炎病毒的遗传特征和分子进化
Qin Guo1, Shuangli Zhu2, Dongyan Wang2
1National Polio Laboratory, WHO WPRO Regional Polio Reference Laboratory, National Health Commission Key Laboratory for Biosecurity, National Health Commission Key Laboratory for Medical Virology, National Institute for Viral Disease Control and Prevention, Chinese Center for Disease Control and Prevention Beijing, China; Da Zhou Vocational College of Chinese Medicine, Dazhou, China.
Virus research
|July 21, 2023
概括
2013年中国的一例免疫缺陷疫苗衍生的脊髓灰质炎病毒 (iVDPV) 在298天内表现出复杂的演变. 主导的B血统和复合模式表明OPV感染源于最后一剂疫苗.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 分子进化分子进化
- 疫苗衍生的病原体
背景情况:
- 2013年,在中国江西省确诊了一例免疫缺陷疫苗衍生型脊髓灰质炎病毒 (iVDPV) 3型病例.
- 这项研究研究了14个IVDPV分离体在298天的分子进化.
研究的目的:
- 为了描述298天内IVDPV分离物的分子进化.
- 研究IVDPV在免疫受损个体中的起源和遗传特征.
主要方法:
- 14个3型IVDPV分离物的净化和遗传特征.
- 使用P1区域和全基因组测序进行了家族遗传学分析.
- 再组合分析,核酸替代率估计 (BEAST) 和温度敏感性测试.
主要成果:
- 观察到复杂的遗传变异和进化关系,有两个主要的血统 (A和B),B血统占主导地位.
- 估计的核酸替代率为1.76 × 10−2替代/地点/年.
- iVDPV被确定为具有两种不同的模式的疫苗间重组剂.
- 与Sabin 3衰减相关的关键突变被替换,一个变体 (Day11-5) 显示了与特定的VP2替换相关的温度抵抗.
- 高血清阳性率持续存在,突变不会显著影响中和能力.
结论:
- iVDPV很可能起源于口服脊髓灰质炎病毒疫苗 (OPV) 的最后一剂量.
- 鉴定到的遗传和表型变化突出显示了IVDPV在免疫受损宿主中复杂的进化动态.
- 尽管发生了突变,但病毒保持了高血清阳性和中和耐药性,这强调了需要继续监测的必要性.
