SETD2变异与瘤突变负担和MSI以及对免疫疗法的改善反应相关
Xiaobin Zheng1, Jing Lin2,3, Jiani Xiong2,3
1Department of Radiation Oncology, Clinical Oncology School of Fujian Medical University, Fujian Cancer Hospital, Fuzhou, 350014, Fujian Province, China.
BMC cancer
|July 21, 2023
概括
SETD2 功能障碍影响免疫检查点抑制剂治疗结果,无论瘤突变负担高 (TMB-H) 状态如何,死亡风险较低. SETD2突变可以作为ICI治疗的预测生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 癌症研究 癌症研究
背景情况:
- SETD2对于基因组稳定性至关重要,在瘤细胞中维持同源重组修复 (HRR) 和不匹配修复 (MMR).
- 在微卫星不稳定性高 (MSI-H) 和瘤突变负担高 (TMB-H) 免疫检查点抑制剂 (ICI) 治疗中SETD2功能障碍的独立作用尚不清楚.
- 在不同癌症类型中SETD2功能障碍的影响需要进一步调查.
研究的目的:
- 调查SETD2功能障碍与TMB-H和MSI-H相关的预后意义,用于各种癌症类型的ICI治疗.
- 确定SETD2功能障碍是否可以作为ICI治疗的独立预测生物标志物.
- 探索SETD2突变,基因组不稳定性和泛癌队列中的临床结果之间的关联.
主要方法:
- 一项大型队列研究,涉及6726个测序样本与多维基因组数据.
- 分析7种实体瘤类型中TCGA和MSKCC队列的MSIsensor评分,HRD评分,RNAseq和突变数据.
- 针对1021个基因的目标面板测序,以确定SETD2突变及其临床相关性.
主要成果:
- SETD2突变与更高的TMB有显著的关联.
- SETD2有害突变预测ICI治疗预后独立于TMB-H,死亡风险较低 (0.511vs0.757).
- SETD2有害突变组显示出显著更高的MSI和更低的HRD,在MSKCC-IO和中国队伍中生存率有所改善.
结论:
- SETD2功能障碍是ICI治疗的独立预后因素,与TMB-H不同,并与死亡风险降低有关.
- SETD2有可能成为ICI治疗的预测生物标志物,特别是在检测到不匹配修复缺陷 (dMMR) 时.
- 与dMMR评估一起考虑SETD2状态可能会改进患者对免疫治疗的选择.
