对三种具有不同棕色植物抗性的品种进行了全面的转录基因分析,确定了大米中的叶 lncRNAs
Kai Liu1, Xiaozhi Ma2, Luyao Zhao1
1Guangzhou Key Laboratory for Research and Development of Crop Germplasm Resources, Guangdong University Key Laboratory for Sustainable Control of Fruit and Vegetable Diseases and Pests & Key Laboratory of Green Prevention and Control on Fruits and Vegetables in South China, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Zhongkai University of Agriculture and Engineering, Guangzhou, 510225, China.
BMC plant biology
|July 21, 2023
概括
这项研究确定了参与防治棕色植物 (BPH) 的大米防御的长非编码RNA (lncRNAs). 这些lncRNAs向耐药基因,并由microRNAs调节,为植物害虫耐药性提供了洞察力.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- RNA生物学的RNA生物学
背景情况:
- 长非编码RNA (lncRNAs) 在生物过程中起着至关重要的作用.
- 在防治棕色植物 (BPH) 的水防御中系统地识别lncRNAs目前尚未探索.
研究的目的:
- 识别和描述涉及到大米对BPH耐药性的lncRNAs.
- 阐明植物害虫相互作用中 lncRNAs 的调节机制.
主要方法:
- 在BPH感染下对大米叶的全基因组高通量测序.
- 分析lncRNA表达,cis/trans-acting活动和目标仿真.
- 权重基因同表达网络分析 (WGCNA) 来构建监管网络.
主要成果:
- 已确定2283个lncRNA,其中649个在BPH感染期间在易受感染的 (TN1) 和耐药的 (IR36,R476) 米品种中差异地表达.
- 确定了针对抗性基因 (NBS-LRR,RLKs) 和转录因子的 lncRNA,以及那些与压力相关的微RNA (miR2118,miR528,miR1320) 的目标.
- WGCNA揭示了IncRNA在BPH反应中的广泛参与,构建了对基底和特定米防御至关重要的监管网络.
结论:
- 在BPH感染期间,在大米中确定了针对miRNA,抗性基因和转录因子的特定lncRNA.
- 构建了响应BPH养的lncRNAs的调控网络,提高了对它们在植物防御中的作用的理解.
- 这些发现为未来对BPH耐药性候选lncRNA的功能研究奠定了基础.
