在与癌症相关的纤维细胞和癌症细胞系之间进行无偏差的差异性蛋白质基因分析

科学领域:

• 癌症生物学 癌症生物学
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 生物标志物发现发现

背景情况:

• 癌症相关纤维细胞 (CAF) 是丰富的 stromal 细胞,影响瘤进展和耐药性.
• 了解CAF蛋白质组可以揭示新的治疗点和生物标志物.

研究的目的:

• 描述肺癌,结肠直肠癌和胰腺癌细胞系及其相应的CAF的蛋白质组.
• 确定新的CAF特定生物标志物,并了解CAF的功能.

主要方法:

• 用同位素标记,液态色谱和质谱分析了9种癌症和3种CAF细胞系的蛋白质组.
• 在瘤样本上进行了功能丰富分析和免疫组织化学分析.

主要成果:

• 对9460种蛋白质的分析揭示了CAF中N-糖甘生物合成和细胞外矩阵蛋白的上调.
• 85种蛋白质在CAF中表达明显更高,包括已知的标记物 (例如FAP) 和新型候选物:热冲击蛋白β-6 (HSPB6) 和循环氧化酶1 (PTGS1).
• 证实HSPB6和PTGS1在瘤样本的层体中过度表达.

结论:

• 这项研究提供了对CAF和癌细胞的无偏见的蛋白质组比较,确定HSPB6和PTGS1是新的,过度表达的CAF生物标志物.
• 蛋白质组数据为进一步研究CAF功能和潜在的 stromal 目标提供了一个资源.