AtOM是一个本体模型,用于在工具,工作流程和数据基础设施中标准化大脑地图的使用
Heidi Kleven1, Thomas H Gillespie2, Lyuba Zehl3
1Department of Molecular Medicine, Institute of Basic Medical Sciences, University of Oslo, Oslo, Norway.
Scientific data
|July 26, 2023
概括
一个新的Atlas Ontology Model (AtOM) 标准化了大脑地图的描述,改善了数据集成和神经科学研究中的共享. 这种机器可读的标准增强了神经科学数据的FAIR原则.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 大脑地图对于描述神经科学数据至关重要,但在命名,分片和定义方面有所不同.
- 不一致的地图标准阻碍了数据集成和分析工具中的使用.
研究的目的:
- 开发一种机器可读的标准,用于表示大脑地图.
- 创建一个统一的框架,用于一致的地图谱描述和互操作性.
主要方法:
- 确定了大脑图谱的四个基本元素.
- 定义了这些元素之间的关系.
- 开发了一个本体模型 (AtOM) 用于标准化地图集表示.
主要成果:
- 介绍了阿特拉斯本体模型 (AtOM).
- 应用AtOM对老鼠,老鼠和人类大脑图谱.
- 证明了AtOM在标准化亚特拉斯描述中的实用性.
结论:
- AtOM促进了大脑图谱的互操作性和数据集成.
- 该模型促进遵守公平数据原则.
- 预计AtOM将加速神经科学数据分析,共享和重用.
