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Updated: Jul 21, 2025

Rapid and Efficient Zebrafish Genotyping Using PCR with High-resolution Melt Analysis

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Published on: February 5, 2014

鱼 (Scophthalmus maximus) 中的TRAF基因家族:识别,表征,分子进化和表达模式分析

Dianyang Zhou¹, Xuangang Wang¹, Hengshun Li¹

¹Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, Ministry of Education, Ocean University of China, 266003, Qingdao, Shandong, China.

Fish & shellfish immunology

|July 27, 2023

概括

这项研究在鱼中确定了八个瘤亡因子受体关联因子 (TRAF) 基因,揭示了它们保留的进化作用和改变的表达,以应对Vibrio anguillarum感染,这对天生的免疫至关重要.

科学领域:

免疫学免疫学免疫学
基因组学就是基因组学.
鱼类生物学鱼类生物学

背景情况:

瘤亡因子受体相关因子 (TRAFs) 是TNF通路中的关键信号蛋白.
有限的研究存在于teleosts的TRAF基因家族,特别是关于它们在鱼天生的免疫力中的作用.

研究的目的:

系统地识别和描述鱼 (Scophthalmus maximus) 中的TRAF基因家族.
为了研究鱼TRAF基因在对细菌感染的反应中的表达模式.

主要方法:

用于识别和注释TRAF基因的生物信息分析.
遗传学,合成和分子进化分析.
定量实时PCR用于分析不同组织中的基因表达和Vibrio anguillarum感染后.

主要成果:

在鱼中发现了8个TRAF基因 (SmTRAF2aa,SmTRAF2ab,SmTRAF2b,SmTRAF3,SmTRAF4a,SmTRAF5,SmTRAF6,SmTRAF7).
SmTRAF成员在远程中被进化保存,拥有像RING finger,MATH和WD40这样的保存域.
在不同组织中,TRAF基因表达有所不同,并在V. anguillarum感染后发生显著变化.

结论:

已识别的鱼TRAF基因被保存,并在天生的免疫反应中发挥作用.
这项研究提供了基本数据,以了解鱼免疫中的TRAF功能.

关键词:

表达方式表达模式.分子进化是分子进化的过程.斯科夫塔尔姆斯最大的最大.交通运输交通运输是什么在V. anguillarum感染.

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Reporter genes are a type of protein-coding gene that are often tagged to a gene of interest. Once inside a target cell, reporter genes usually produce visually identifiable characteristics like fluorescence and luminescence when expressed along with the gene of interest. Thus, reporter genes “report” the presence or absence of genes of interest in an organism, determine the gene expression pattern, or track the physical location of a DNA segment or protein in the cell.