对神经发育障碍的诊断产量和新型候选基因通过在未经选择的小头症队列中通过外基因序列测序
Chunli Wang1, Wei Zhou1, Luyan Zhang1
1Nanjing Key Laboratory of Pediatrics, Children's Hospital of Nanjing Medical University, Nanjing, China.
BMC genomics
|July 27, 2023
概括
整体外基因组测序 (WES) 对于诊断小头症有效,在60%以上的病例中识别出致病变体. 这项研究还发现了神经发育障碍的新型候选基因,扩大了已知的小头症遗传原因.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 神经发育障碍 神经发育障碍
- 基因组医学是基因组医学.
背景情况:
- 微头症的特征是大脑体积减少,经常与神经发育障碍 (NDD) 相关.
- 识别小头症的遗传基础对于诊断和了解疾病机制至关重要.
研究的目的:
- 在未经选择的中国小头症患者队列中评估整个外体序列 (WES) 的诊断产量.
- 为了确定与小头症和相关的NDDs相关的新型候选基因.
主要方法:
- 整体外体序列测序 (WES) 在103名患有小头症的患者身上进行.
- 复制号变异 (CNV) 分析与WES数据相结合.
- 候选变异的功能验证在细胞培养中进行.
- 一个大型的NDDs基因组测序数据库被查询了额外的案例.
主要成果:
- 在63.1%的家庭中确定了致病变体.
- 在使用WES与覆盖范围分析的情况下,在15.5%的病例中检测到临床相关的CNV.
- 8个家族 (7.8%) 的新候选基因 (例如,CCND2,DOCK9,PWP2) 的变异涉及细胞循环,活性组织,神经发生和转录.
- 在一个更大的NDD队列中发现了另外两个具有DOCK9和PPP1R9B变异的病例.
结论:
- 微头是一个强大的诊断工具微头,产生显著的诊断率.
- 这项研究扩大了与单一性NDD和小头症相关的基因谱.
- 对于小头症患者来说,WES应该被视为一级诊断测试.
