向非侵入性采集方法采样糖尿病足的微生物群
Dorothy Jeanette Travis1, Joanne Bradbury2, Kirsten Benkendorff3
1Faculty of Science and Engineering, Southern Cross University, Lismore, Australia.
International wound journal
|July 27, 2023
概括
组织和拭子都有效地捕获了糖尿病足的微生物群. 这一发现有助于为慢性伤口感染选择适当的抗菌疗法.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 伤口护理 伤口护理
背景情况:
- 慢性糖尿病足 (DFU) 拥有复杂的微生物组.
- 准确的微生物组识别对于有效的抗菌治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 为了比较从慢性DFU中的配对组织擦拭和拭子样本中获得的微生物组概况.
- 评估使用培养和16S rRNA基因测序的两种常见样本采集方法 (拭子与组织取) 的疗效.
主要方法:
- 从患有慢性DFU的参与者中收集了配对组织除和拭子样本.
- 使用传统培养技术和16S rRNA基因测序进行了微生物组分析.
- 分析了细菌社区的组成,丰富性,多样性和关键属的丰富性.
主要成果:
- 这两种方法都显示出相似的平均丰富度和多样性 (OTUs,Shannon's H).
- 通过这两种方法,培养和测序捕获了不同百分比的被选择的致病性属.
- 虽然一些病原体的相对丰富度 (葡萄球菌, Pseudomonas) 在抽样中较高,但多变量分析显示样品类型之间的总体细菌群体组成没有显著差异.
结论:
- 当通过培养和16S rRNA基因测序分析时,组织取和拭子都有效捕获慢性DFU的微生物组.
- 方法的选择可能取决于特定的病原体检测需求,尽管社区的整体结构是可比的.
- 这些发现支持使用这两种方法来指导DFU治疗决策.


