使用碳足迹测定,绘制人类气体皮质D和人类卡斯巴酶-1之间的结合相互作用的地图
James R Lloyd1, Antonio Biasutto2, Katharina L Dürr2
1School of Chemistry, University of Nottingham, University Park, Nottingham NG7 2RD, U.K.
JACS Au
|July 28, 2023
概括
碳足迹检测显示,人体Gasdermin D与人体Caspase-1活性部位直接结合. 这种技术还显示了Gasdermin D如何插入脂质二层,以及抑制剂如何与Caspase-1相互作用.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 化学生物学 化学生物学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 蛋白质与蛋白质的相互作用对于细胞过程至关重要.
- 卡斯巴-1和加斯德明D是炎症细胞死亡的关键调节剂.
- 了解它们的相互作用对于治疗的发展至关重要.
研究的目的:
- 通过使用碳足迹,研究人类Caspase-1 (C285A) 和人类Gasdermin D (hGSDMD) 之间的结合相互作用.
- 阐明hGSDMD在膜孔形成中的作用.
- 为了研究Caspase-1与抑制剂VRT-043198.8的相互作用.
主要方法:
- 碳足迹,一种基于质谱的化学标签技术.
- 分析蛋白质结合接口和形状变化.
- 脂质体中全长hGSDMD及其N终端域的差异标记.
主要成果:
- 结合时在hCaspase-1和hGSDMD上确定了被掩盖的区域,这表明了活性部位和外位相互作用.
- 提供了hGSDMD占据hCaspase-1活性位点的第一个直接证据.
- 通过抑制剂VRT-043198.8证明了C285A突变活性位点的碳标记.
- 在脂质体中显示hGSDMD N-终端域的掩盖,与寡合化和膜插入相一致.
结论:
- 碳足迹对于研究Caspase-1/GSDMD系统中的蛋白质-蛋白质相互作用是有效的.
- 这项研究揭示了对炎症细胞死亡的分子机制的新见解.
- 这些发现有助于进一步了解卡斯巴-1抑制和加斯德明D孔隙形成.
