在蛋白质环境中,近距离启用的硫化物交换反应
Bingchen Yu1, Li Cao1, Shanshan Li1
1Department of Pharmaceutical Chemistry, The Cardiovascular Research Institute, Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, University of California San Francisco 555 Mission Bay Blvd. South San Francisco California 94158 USA Lei.wang2@ucsf.edu.
硫交换 (SuFEx) 在细胞和体内形成共价蛋白链. 这项研究揭示了SuFEx蛋白质动力学,这对于开发新的蛋白质药物和理解相互作用至关重要.
科学领域:
- 化学生物学 化学生物学
- 生物化学 生物化学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 硫交换 (SuFEx) 反应使细胞环境和体内生物体中的共价蛋白连接成为可能.
- 了解蛋白质-蛋白质共价链接形成的动力学对于在研究和治疗中推进共价蛋白应用至关重要.
- 对于蛋白质SuFEx反应的基本动力学和性质数据仍然在很大程度上未被探索.
研究的目的:
- 系统地研究各种条件下的蛋白质中SuFEx反应的动力学和基本特性.
- 阐明SuFEx在相互作用蛋白中的机制,并确定影响其速率的因素.
- 评估SuFEx适用于体内应用的适用性及其在生物疗法开发中的潜力.
主要方法:
- 在不同蛋白质和实验条件下对SuFEx反应的系统动力学研究.
- 分析相互作用蛋白中的SuFEx机制,区分非共价和共价阶段.
- 对纳米体SR4与SARS-CoV-2尖端蛋白结合的动力分析,包括病毒突变的影响.
主要成果:
- 在相互作用的蛋白质中,SuFEx遵循两步机制 (非共价结合,然后共价键形成),非线性速率取决于蛋白质度.
- SuFEx速率受到蛋白质结合亲和力,功能组反应性,标残留物标识和溶液pH的影响.
- 在SARS-CoV-2尖端蛋白中的病毒突变降低了SuFEx速率和亲和力,但没有取消共价结合;在人血清中没有观察到异交叉链接,并且在酸性pH下链接是稳定的.
结论:
- 该研究提供了对蛋白质中的SuFEx反应性和动力学的全面了解.
- 这些发现突显了SuFEx在体内应用的潜力,因为其稳定性和特异性.
- 这项工作对于开发用于生物研究和生物治疗的SuFEx-enabled共价蛋白非常有价值.
更多相关视频
10:31Residue-Specific Exchange of Proline by Proline Analogs in Fluorescent Proteins: How "Molecular Surgery" of the Backbone Affects Folding and Stability
Published on: February 3, 2022
08:43A Fluorescence Fluctuation Spectroscopy Assay of Protein-Protein Interactions at Cell-Cell Contacts
Published on: December 1, 2018
相关概念视频
Protein Complexes with Interchangeable Parts
The SCF ubiquitin ligase is a protein complex of five individual proteins. This complex attaches ubiquitin to other target proteins to mark them for degradation. In order...
Sulfur Assimilation
Protein Modifications in the RER
Broadly, these modifications can be categorized into four main categories — glycosylation, formation of disulfide bonds, assembly of protein subunits, and specific proteolytic cleavages like removal of signal...
Phase II Reactions: Sulfation and Conjugation with α-Amino Acids
