16S 在处理新鲜农产品的配送中心对微生物群落的微生物组分析
Anna Townsend1, Hendrik C den Bakker2, Amy Mann2
1Department of Food Science and Technology, University of Georgia, Athens, GA, United States.
Frontiers in microbiology
|July 28, 2023
概括
食品配送中心 (DC) 中的微生物群落在很大程度上是未知的. 这项研究发现耐寒细菌,包括Carnobacterium,Psychrobacter和Pseudomonas,在检测到Listeria的DC中更为丰富.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 环境科学 环境科学
- 食品安全 食品安全
背景情况:
- 配送中心 (DC) 是食品供应链中的关键节点,但它们的微生物生态学仍未得到充分研究.
- 食物传播的病原体可以殖民食品设施,引发人们对食品DC中潜在的污染风险的担忧.
研究的目的:
- 描述在食品配送中心的表面上存在的微生物群落.
- 调查Listeria物种在这些环境中的潜在存在和联系.
主要方法:
- 来自18个美国食品DC的317个环境表面抹布的16S片测序.
- 并行微生物样本采集以检测有生命力的Listeria物种.
- 用于分类学分类和差异丰度的生物信息分析.
主要成果:
- 在不同的DC中观察到微生物多样性的显著变化.
- 鉴定到的顶级细菌系包括Carnobacterium_A,Psychrobacter,Pseudomonas_E,Leaf454和Staphylococcus. 这些细菌系中,最常见的细菌是菌_A,Psychrobacter,Pseudomonas_E,Leaf454和Staphylococcus.
- 耐寒的细菌,特别是Carnobacterium_A,Psychrobacter和Pseudomonas_E,在阳性李斯特菌样本中显著更多.
结论:
- 食品分发中心拥有多样化的微生物群落,显着存在耐寒细菌.
- 特定的细菌属与李斯特菌的存在有关,突出显示了潜在的污染风险微生物指标.
- 微生物组组成受到DCs内的位置,季节和采样地点等因素的影响.
