基于Xanthomonas euvesicatoria pv. 的全基因组序列分类 白和计算分析的第三类分泌系统的分泌系统
Manoj Choudhary1,2, Gerald V Minsavage1, Erica M Goss1
1Department of Plant Pathology, University of Florida, Gainesville, FL 32611.
Phytopathology
|July 28, 2023
概括
来自白植物的新Xanthomonas菌株被确定为一个独特的病原体,Xanthomonas euvesicatoria pv. 优卡利普蒂. 优卡利普蒂. 这些菌株缺乏相关病原体中发现的关键毒性因子,这解释了它们无法感染西红和胡植物的原因.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 细菌学 细菌学是一门学科.
- 基因组学就是基因组学.
- 人类遗传学 是一个学科.
背景情况:
- 克桑托蒙纳斯 (Xanthomonas) 种类. 是重要的植物病原体,影响广泛的宿主.
- 树苗中的细菌病原始归因于Xanthomonas perforans. 这种细菌病原始地归因于Xanthomonas.
- 以前的鉴定缺乏对番茄和胡等常见宿主的致病性确认.
研究的目的:
- 为了描述从树植物中分离出来的Xanthomonas菌株.
- 确定这些菌株的遗传关系和病原性.
- 为了研究它们宿主特异性的遗传基础.
主要方法:
- 整基因组测序了8个Eucalyptus隔离的Xanthomonas菌株.
- 平均核酸标识 (ANI) 分析用于分类学分类.
- 核心基因组分类来建立进化关系.
- 在番茄和胡植物的病原性测定.
- 对效应蛋白和HRP集群进行比较基因组分析.
主要成果:
- 树菌株显示高ANI (>97.8%) 与Xanthomonas euvesicatoria路径变种.
- 遗传学分析将这些菌株与X.euvesicatoria pv.结合在一起. 红色,与X. perforans. 不同.
- 树菌株被指定为Xanthomonas euvesicatoria pv. 这些树菌株被指定为Xanthomonas euvesicatoria pv. 欧卡利普蒂 (Xee). . 在这里.
- 与Xp和Xeu相比,Xee菌株缺乏核心效应因子XopD,并具有不同的HrpE蛋白质.
- 证实HrpE对于Xee的III型效应体分泌是必不可少的.
结论:
- 树菌株代表了一个新的病原体,Xanthomonas euvesicatoria pv. 欧卡利普蒂 (Xee). . 在这里.
- 独特的遗传特征,包括没有XopD和HrpE的变异,有助于Xee的致病性和宿主范围.
- 这项研究完善了Xanthomonas的分类学,并提供了对毒性因素演变的见解.
