在印度孟买的三次SARS-CoV-2病毒浪潮期间的PCR测试阳性和病毒载量

科学领域:

• 流行病学 流行病学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 标准的SARS-CoV-2 PCR测试提供了二元结果,限制了流行病学见解.
• 了解印度病毒浪潮期间的SARS-CoV-2传播动态至关重要,但仍未得到充分探索.

研究的目的:

• 使用来自孟买的定量PCR数据分析SARS-CoV-2病毒载荷模式.
• 通过人口统计和人口密度来调查病毒载荷的特定波段差异.

主要方法:

• 来自孟买的270万个实时PCR记录的分析.
• 利用逆周期值 (Ct) 值来估计社区级病毒载量.
• 不同的SARS-CoV-2波浪,年龄组,性别和贫民窟密度之间的量化变化.

主要成果:

• 在不同波的PCR阳性显著变化:3.4% (非爆发),9.9% (三角形),23.2% (原始) 和42.8% (奥米克朗).
• 通过中位数Ct值表示的社区级病毒载荷,在阳性率变化之前7-14天.
• 与非爆发期相比,在三角洲和欧米克朗波期间的病毒载量是四倍的,并观察到特定的人口结构模式.

结论:

• 使用Ct值的定量PCR为监测SARS-CoV-2病毒载量和传播提供了一个实用的工具.
• 孟买的病毒浪潮表现出高的病毒载荷,提供了流行病轨迹的早期指标.
• 病毒载荷的人口和密度相关差异在各波中各不相同,老年人始终表现出更高的负载.