重新利用抗登革热化合物对抗水病毒,准核心氨酸蛋白酶
Mohd Imran1, Abida1, Nawaf M Alotaibi2
1Department of Pharmaceutical Chemistry, College of Pharmacy, Northern Border University, Rafha 91911, Saudi Arabia.
Biomedicines
|July 29, 2023
概括
研究人员确定了两种潜在的药物化合物,CHEMBL32926和CHEMBL4861364,使用基于结构的药物设计来抑制麻疹病毒 (MPXV) 核心氨酸蛋白酶. 这些化合物表现出强大的结合和类似药物的特性,为MPXV治疗提供了一个有前途的策略.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 药物发现 药物发现 药物发现
- 计算化学计算化学
背景情况:
- 病毒 (MPXV) 是一种双链DNA病毒,导致全球公共卫生紧急情况.
- MPXV属于Orthopoxvirus属,已经蔓延到非流行地区.
- 有效的抗病毒疗法对于管理MPXV疫情至关重要.
研究的目的:
- 通过基于结构的药物设计方法,识别MPXV核心氨酸蛋白酶的潜在抑制剂.
- 评估已识别的化合物的结合亲和力和类似药物的特性.
- 探索针对MPXV感染的新型治疗策略.
主要方法:
- 采用基于组合的蛋白质-连接体对接来模拟与MPXV囊蛋白酶的相互作用.
- 利用分子动态模拟来确认结合稳定性和分析相互作用机制.
- 执行了MMGBSA具有约束力的自由能量计算和机器学习模型,用于IC50对类型的预测.
主要成果:
- 确定了两个强大的抑制剂,CHEMBL32926和CHEMBL4861364,具有高的对接分数 (-10.7和-10.9 kcal/mol).
- 在分子动力学模拟中证实了抑制剂与蛋白的稳定结合.
- 发现了具有相似结合亲和力的类似物,表明可用于药物开发的可行的化合物.
结论:
- 基于结构的药物设计是发现新型MPXV抑制剂的有希望的策略.
- CHEMBL32926和CHEMBL4861364显示出作为MPXV抗病毒药物开发的起点的巨大潜力.
- 对这些化合物及其类型的进一步研究可能会导致对水的有效治疗方法.
