在西澳大利亚从马身上检测到的 Clostridioides difficile 的基因组分析
Natasza M R Hain-Saunders1, Daniel R Knight2,3, Mieghan Bruce1,4
1Centre for Biosecurity, and One Health, Harry Butler Institute, Murdoch University, Murdoch, WA 6150, Australia.
Microorganisms
|July 29, 2023
概括
困难菌 (CDI) 在澳大利亚马中普遍存在,在马,人类和环境之间发现了共同的菌株. 这表明了物种间的传播和需要一个健康的方法来控制CDI.
科学领域:
- 兽医流行病学 兽医流行病学
- 微生物学 微生物学
- 一个健康,一个健康.
背景情况:
- 困难菌导致人类和动物,包括马的显著胃肠道疾病.
- 越来越多的社区相关的C. difficile感染 (CDI) 和跨物种传播的证据需要更广泛的视角来控制CDI.
- 在马群中,C. difficile是导致腹和结肠炎的主要原因.
研究的目的:
- 调查澳大利亚马匹中CDI的流行病学.
- 探索来自马类,人类和环境来源的C. difficile菌株之间的遗传关系.
- 提供对潜在的物种间传播途径的见解.
主要方法:
- 收集和分析了来自西澳大利亚387匹马的752个便样本.
- 隔离和识别C. difficile,包括毒性菌株和PCR核型 (RTs).
- 45种C. difficile菌株的全基因组测序和遗传学分析.
主要成果:
- 从没有胃肠道症状的马的30.9%和有症状的马的37.8%中分离出C. difficile.
- 在55.3%的隔离物中发现了毒性菌株,其中RTs 012,014/020和087是突出的.
- 全基因组分析揭示了来自马,人类和环境来源的10种密切相关的C. difficile RT 012菌株的集群,表明最近的共同祖先.
- 证据表明可能的克隆性物种间传播或马和人类隔离子组之间的共同来源暴露.
结论:
- 困难菌在澳大利亚马群中普遍存在,影响健康和生病的动物.
- 马类,人类和环境中C. difficile菌株的遗传关系突出显示了潜在的传播途径.
- 一个健康战略对于跨物种有效监测和控制C. difficile感染至关重要.
更多相关视频
09:44Characterization of a Pathogenic Escherichia coli Strain Derived from Oreochromis spp. Farms Using Whole-Genome Sequencing
Published on: December 23, 2022
2.2K
10:33Multi-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis of the Fish-pathogenic Bacterium Yersinia ruckeri by Multiplex PCR and Capillary Electrophoresis
Published on: June 17, 2019
10.9K
