在巴西从河水中分离出来的Salmonella菌体的分子表征

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 环境科学 环境科学

背景情况:

• 抗菌素耐药性是一个日益增长的全球健康威胁,需要新的治疗策略.
• 菌体 (菌体) 是感染细菌的病毒,为控制细菌病原体提供了抗生素的潜在替代品.
• 沙门氏菌物种是导致食物传播疾病和医院感染的重要原因.

研究的目的:

• 隔离和描述一种具有抗沙门氏菌物种性活性的新型细菌菌体.
• 确定隔离的菌体的完整基因组序列并分析其遗传构成.
• 评估菌体的治疗和生物控制潜力.

主要方法:

• 从Subaé河流域的环境水样中分离了菌体Wara,巴西.
• 使用牛津纳米孔技术 (ONT) 的全基因组测序MinION和Illumina HiSeq.
• 使用Racon和Unicycler进行基因组组装,随后进行生物信息学注释和遗传学分析.

主要成果:

• 成功获得了沙门氏菌瓦拉的完整基因组序列,MinION和Racon组合产生了最好的结果.
• 遗传学分析将Wara置于Tequintavirus属中.
• 瓦拉缺乏与 lysogeny,抗微生物耐药性和毒性相关的基因,这表明它是一种安全的性特征.

结论:

• 菌体Wara是治疗和生物控制应用在沙门氏菌感染的有希望的候选者.
• 菌体的遗传特征表明其在临床环境和农业应用中都有使用潜力.
• 环境监测可以成为发现抗生素耐药性的新菌体的宝贵来源.