改进的反转录循环介导同热放大 (RT-LAMP) 用于快速和灵敏地检测马赛克病毒
Ruth O Festus1, Susan E Seal1, Ruth Prempeh2
1Natural Resources Institute, University of Greenwich, Central Avenue, Chatham Maritime, Kent ME4 4TB, UK.
Viruses
|July 29, 2023
概括
开发了一种新的Yam马赛克病毒 (YMV) 诊断测试,提高了种子的质量. 这种增强的反转录循环介导同热放大 (RT-LAMP) 测试确保了更健康的种植材料,以提高木的生产力.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子诊断学 分子诊断学
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 亚姆 (Dioscorea spp.) 是一种植物. 由于缺乏正式的种子系统,生产受到阻碍,导致依赖受感染的植物材料.
- 病毒感染,特别是山姆马赛克病毒 (YMV),显著降低山姆产量,危及粮食安全.
- 准确的诊断工具对于开发经过认证的种子系统以减轻病毒引起的损失至关重要.
研究的目的:
- 为了解决现有的RT-LAMP和RT-PCR方法在Yam马赛克病毒 (YMV) 检测中的差异.
- 开发和验证一种更灵敏,更可靠的诊断测试,用于种子中的YMV.
- 支持建立一个可持续的种子玉米认证计划.
主要方法:
- 对RT-LAMP和RT-PCR用于YMV检测在yam加入的比较分析.
- 设计和优化一套新的循环介导同热放大 (LAMP) 开启器 (YMV1-OPT).
- 使用净化病毒RNA的新YMV1-OPT LAMP试验的灵敏度测试.
主要成果:
- 最初的RT-LAMP测定显示出较低的灵敏度,未能通过RT-PCR检测出阳性样本中的YMV.
- 新设计的YMV1-OPT LAMP原料表现出高灵敏度,检测到只有0.1 fg/μL的YMV RNA.
- 优化的RT-LAMP试验的灵敏度与RT-PCR的灵敏度相当.
结论:
- YMV1-OPT LAMP测试提供了一种快速,灵敏和具有成本效益的YMV检测方法.
- 这种优化的诊断工具被推用于种子玉米生产中的常规病毒索引.
- 该测试的实施将提高种子的质量,减少病毒传播,并提高整体生产率.
