塑核相互作用的基因组分析和Juglandaceae物种中共进化的基因的差异性进化率
Yang Yang1, Evan S Forsythe2,3, Ya-Mei Ding1,4
1State Key Laboratory of Earth Surface Processes and Resource Ecology, and Ministry of Education Key Laboratory for Biodiversity Science and Ecological Engineering, College of Life Sciences, Beijing Normal University, Beijing, China.
研究人员使用进化速率共变识别了Juglandaceae中的核基因与 хлоропласт基因组共同进化. 超过四分之一的核基因表现出共同进化,特别是与叶子发育和应激反应相关的基因.
科学领域:
- 植物基因组学 植物基因组学
- 进化生物学是进化的生物学.
- 分子遗传学 分子遗传学
背景情况:
- 核和叶绿体基因组在植物细胞功能上相互作用.
- 在全基因组范围内识别共同进化的核和叶绿体基因是具有挑战性的.
研究的目的:
- 为了确定核基因与Juglandaceae中的质细胞基因组共同演变.
- 分析核和叶绿体基因之间的进化速率共变.
主要方法:
- 进化速率的共同变量分析.
- 利用了9个木兰属植物物种中的4,894个正核基因和76个叶绿体基因.
- 检查了七个叶绿体分区.
主要成果:
- 1369个 (27.97%) 的核基因显示出与质体基因组的共同进化特征.
- Ycf1/2分区有最多的命中次数 (765),ClpP1的命中次数最少 (13).
- 同进化的基因在叶子发育,光周期和非生物应激反应途径中得到了丰富.
结论:
- 在叶绿体分区间共进化的核基因数量存在显著差异.
- 同进化模式和进化速率与Juglandaceae中的核基因和叶绿体基因相关.
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