与胰腺癌免疫微环境和个性化治疗相关的PANoptosis相关的分子亚型和预后模型
Biao Zhang1, Bingqian Huang1,2, Xiaonan Zhang1,2
1Department of General Surgery, Clinical Laboratory of Integrative Medicine, The First Affiliated Hospital of Dalian Medical University, Dalian, China.
Frontiers in oncology
|July 31, 2023
概括
炎症性细胞死亡的PANoptosis与胰腺癌 (PC) 和其瘤微环境有关. 这项研究确定了PC亚型和基于PANoptosis相关基因的预后模型,以预测患者的存活率.
科学领域:
- 细胞生物学 细胞生物学
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 泛亡是一种炎症编程细胞死亡途径,涉及癌症病原和瘤免疫微环境.
- 在胰腺癌 (PC) 病原发生过程中,PANoptosis的特定机制在很大程度上仍未被探索.
- 了解PC中的PANoptosis对于开发新型治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 在胰腺癌中识别与PANoptosis相关的分子亚型.
- 构建和验证基于PANoptosis相关基因预测患者生存的预后模型.
- 研究PANoptosis在胰腺癌发病过程中的作用及其与瘤免疫微环境的关联.
主要方法:
- 从TCGA和GEO数据库下载了PC的转录学,临床,拷贝数变异,甲基化和突变数据.
- 确定了与PANoptosis相关的基因 (PANRGs),并进行了共识聚类来定义分子亚型.
- 使用LASSO和Cox回归分析构建并验证了一个预后模型;通过RT-qPCR验证了基因表达.
主要成果:
- 从66个PANRG中确定了24个PC特异性预后相关基因,揭示了各种癌症中复杂的遗传变异.
- 将PC患者分为两种亚型 (PANcluster A和B),其中PANcluster A呈现出更差的预后和独特的免疫细胞透模式.
- 开发了一种经过验证的预后模型,并根据亚型发现针对向疗法的差异敏感性;PC组织中CXCL10和ITGB6表达升高.
结论:
- 成功识别了与PANoptosis相关的分子亚型,并建立了胰腺癌的预后模型.
- 这些发现提供了关于PANoptosis在PC病原和患者生存中的作用的见解.
- 这项研究为进一步研究向PANoptosis用于胰腺癌治疗奠定了基础.
