组织pH值和RNA完整数对人类死后大脑基因表达的影响
Kazusa Miyahara1, Mizuki Hino1,2, Zhiqian Yu3
1Department of Disaster Psychiatry, International Research Institute of Disaster Science, Tohoku University, Sendai, Japan.
Frontiers in psychiatry
|July 31, 2023
概括
组织pH和RNA完整数 (RIN) 在死后大脑研究中显著影响基因表达. 了解这些影响对于控制分子致病学研究中的混因素至关重要.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 研究人类死后大脑中的分子病原体需要控制混因素.
- 组织pH值和RNA完整性数 (RIN) 是控制混物的关键指标.
- pH和RIN对死后脑组织基因表达的影响仍未得到充分研究.
研究的目的:
- 评估组织pH和RIN对人类大脑样本中的基因表达的影响.
- 为了识别死后大脑中受pH和RIN影响的基因组.
- 在未来的死后大脑研究中,为控制混因素提供见解.
主要方法:
- 从13名精神分裂症患者的头后叶中分离出总RNA.
- 测量了RNA完整数 (RIN) 和组织pH值.
- 进行了基因表达分析,丰富分析和上游调节器分析.
主要成果:
- 2,043个与pH相关的基因 (24.7%) 的表达;3,004个与RIN相关的基因 (36.3%);1,293个与两者相关的基因 (15.6%) 的表达.
- 受pH和RIN影响的基因与能量生产和免疫系统功能有关.
- 独特受pH影响的基因与细胞周期有关,而独特受RIN影响的基因与RNA处理有关.
结论:
- 这项研究阐明了pH和RIN对死后大脑基因表达概况的影响.
- 受组织pH或RIN影响的已识别的基因组有助于控制混杂物.
- 这些发现支持使用死后脑组织进行更准确的分子病原学研究.
