基于生物信息学的免疫细胞透分析揭示了冠状动脉疾病的新生物标志物
Tianwen He1,2, Muheremu Muhetaer1,2, Jiahe Wu1,2
1Department of Cardiology, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan, People's Republic of China.
Journal of inflammation research
|August 1, 2023
概括
研究人员将CHFR,CEL和CCD28A确定为冠状动脉疾病 (CAD) 的新型免疫相关生物标志物. 这些发现为早期的非侵入性诊断和免疫治疗这种复杂的免疫疾病提供了潜力.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 冠状动脉疾病 (CAD) 被认为是一种多因素免疫疾病.
- 导致CAD的特定免疫机制需要进一步研究.
- 识别新的与免疫相关的标志物对于理解和管理CAD至关重要.
研究的目的:
- 为了确定冠状动脉疾病 (CAD) 的新型免疫相关生物标志物.
- 探索免疫细胞透在CAD病变发生过程中的作用.
- 为了验证CAD的潜在诊断和治疗目标.
主要方法:
- 使用了三个CAD相关的基因表达数据集 (GSE12288,GSE98583,GSE113079).
- 对差异表达基因 (DEGs) 进行了基因本体学,KEGG通路和加权基因共表达网络分析.
- 用于免疫细胞透分析的CIBERSORT和用于临床样本中特征基因识别和验证的LASSO回归.
主要成果:
- 确定了204个上调和339个下调的DEGs,这些DEGs在"Apoptosis"和"Th17细胞分化"等途径中得到丰富.
- 使用LASSO回归识别了五个特征基因 (LMAN1L,DOK4,CHFR,CEL,CCD28A).
- 在CAD患者中观察到激活的CD8 T细胞和CD56 DIM自然杀手细胞的比例较低;CHFR,CEL和CCD28A在患者血液样本中表现不同.
结论:
- 鉴定出CHFR,CEL和CCD28A是潜在的生物标志物,与CAD中的免疫透有关.
- 这些生物标志物可以作为CAD早期非侵入性诊断的目标.
- 这些发现有助于开发冠状动脉疾病的潜在免疫疗法策略.
