一个潜在的自相关的基因基因在患有孕前的患者的签名
Jiayu Shen1, Xinyuan Teng1, Jiayao Zhao1
1Department of Obstetrics, The Second Affiliated Hospital of Zhejiang University School of Medicine, 310009 Hangzhou, Zhejiang, China.
Frontiers in bioscience (Landmark edition)
|August 1, 2023
概括
这项研究确定了关键的自相关基因 (ATG) 作为孕前 (PE) 的潜在生物标志物. 四个ATG的签名在胎盘和血液样本中表现出高的诊断准确性,有助于PE预测.
科学领域:
- 基因组学和分子生物学
- 生殖医学 生殖医学
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- 孕前 (PE) 对母亲和后代的健康构成重大风险.
- 确定PE可靠的诊断标记对于及时干预至关重要.
- 与自相关的基因 (ATG) 在各种与妊娠并发症相关的细胞过程中发挥作用.
研究的目的:
- 为了确定与自相关基因 (ATG) 的潜在诊断特征,在因子宫前 (PE) 复杂的怀孕中.
- 探索ATG在PE发展背后的分子机制中的作用.
主要方法:
- 从胎盘 (GSE75010) 和血液 (GSE48424) 样本分析了mRNA表达特征,以确定PE中差异表达的ATG.
- 利用生物信息学工具,包括基因本体学,KEGG通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络.
- 采用LASSO逻辑回归和SVM-RFE用于诊断标记查,并使用ROC分析进行预测价值评估.
- 预测和验证了针对已识别的ATG的目标miRNA,构建了一个miRNA-mRNA调节网络.
主要成果:
- 在PE和健康怀孕之间确定了20种不同表达的ATG.
- 功能丰富分析显示,ATG参与了自,亡,血管生成和炎症途径.
- 四个ATG的签名 (LEP,ERO1L,PIK3CB,MAPK8) 在胎盘 (AUC=0.869) 和血液 (AUC=0.914) 样本中表现出极好的诊断效果.
- 构建了一个涉及11个miRNA和已识别的ATG的调控网络.
结论:
- 建立了与自相关的基因特征,显示了预测孕前的潜力.
- 构建了一个新的miRNA-mRNA调节网络,为PE的分子机制提供了洞察力.
- 这些发现有助于更深入地了解PE病原和生物标志物发展.
更多相关视频
05:31Author Spotlight: Modeling an Aspect of Preeclampsia in Female Mice Using Hypoxic Human Placenta-Derived Small Extracellular Vesicles
Published on: January 26, 2024
864
05:30Trophoblast Cell Recovery from Angiogenesis-Tube Formation Assay for Differentiation Marker Expression Analysis
Published on: November 8, 2024
522
