对不同年龄的血迹进行定量PCR分析
Nadescha Viviane Hänggi1, Øyvind Bleka2, Cordula Haas1
1Zurich Institute of Forensic Medicine, University of Zurich, Switzerland.
Forensic science international
|August 1, 2023
概括
法医科学家现在可以使用mRNA降解方法估计血污的年龄. 这种经过验证的技术通过更准确地确定沉积以来的时间 (TsD) 来帮助调查.
科学领域:
- 法医科学 法医科学 法医科学
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 准确估计生物污点沉积后的时间 (TsD) 对法医调查至关重要.
- 现有的基于mRNA的TSD估计方法显示了受转录位置影响的降解模式.
- 这些方法在不同实验室中的可重复性对于其实际应用至关重要.
研究的目的:
- 复制和验证一种基于mRNA的方法,用于估计血污沉积后的时间 (TsD).
- 为了评估血液特异性标记物 (ALAS2) 在测试中是否包含.
- 开发和评估使用弹性净回归进行 TsD 估计的预测模型.
主要方法:
- 重现了基于实时PCR (qPCR) 的定量测定,针对四个转录 (B2M,LGALS2,CLC,S100A12) 并添加ALAS2.2.
- 研究了选定的转录的5'到3'末端降解模式.
- 开发了弹性净回归模型,使用来自两个独立实验室的训练数据,分别和组合,以预测TSD.
主要成果:
- 在长达320天的综合数据集上训练的弹性网模型显示出最好的预测性能 (平均绝对偏差[MAD]=18.9天).
- 在两个实验室之间观察到预测性能的显著变化.
- 当被限制在100天时,一个实验室实现了2.0天的MAD (根据自己的数据进行培训),而另一个实验室则实现了15天.
结论:
- 经过验证的mRNA降解方法对估计血污年龄具有前景,有助于法医调查.
- 包括ALAS2并没有改变观察到的降解模式.
- 实验室特定的培训数据提高了预测准确度,突出了对本地化模型校准或进一步标准化的需求.
