在唾液中识别SARS-CoV-2生物标志物通过转录和蛋白质组学分析
Lina M Marin1, George S Katselis2, Paulos Chumala2
1College of Dentistry, University of Saskatchewan, Saskatoon, SK, S7N 5E5, Canada.
Clinical proteomics
|August 3, 2023
概括
质谱检测 (MS) 在100%的COVID-19唾液样本中检测到SARS-CoV-2蛋白质,超过实时PCR (rRT-PCR) 灵敏度. 这种先进的MS方法为COVID-19诊断和监测提供了更敏感的方法.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 传染病诊断 传染病诊断 传染病诊断
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 实时PCR (rRT-PCR) 检测SARS-CoV-2的灵敏度有局限性,特别是在低病毒载量和疾病严重程度的情况下.
- 质谱 (MS) 尚未广泛探索用于识别唾液中的SARS-CoV-2蛋白质,这是一个易于获取的样本类型.
研究的目的:
- 评估基于质谱的蛋白质组学的翻译适用性,用于识别COVID-19患者唾液中的SARS-CoV-2蛋白质.
- 将MS的诊断性能与rRT-PCR用于唾液中检测SARS-CoV-2进行比较.
主要方法:
- 在诊断后14天内,从42名COVID-19阳性和16名健康个体收集了唾液样本.
- 蛋白质被提取,消化,并使用液体染色学-四极点飞行时间联质谱法 (LC-QTOF-MS/MS) 进行分析.
- 与SARS-CoV-2和人类蛋白质数据库相结合,进行了谱查询;rRT-PCR用于病毒RNA检测.
主要成果:
- 在100%的COVID-19阳性样本中发现了SARS-CoV-2蛋白质,而rRT-PCR对病毒RNA的检测率为57.1%.
- 复制多蛋白1ab和1a以及核蛋白是最常被检测到的病毒蛋白之一.
- 从健康个体的样本中没有检测到病毒蛋白或RNA.
结论:
- 基于质谱的蛋白质组学在检测唾液中的SARS-CoV-2生物标志物方面表现出比rRT-PCR更高的灵敏度.
- 多发性硬化技术显示出作为初始COVID-19诊断和随访的有效诊断工具的承诺,特别是在病毒载量低的病例中.
关键词:
生物标志物 生物标志物质谱测量质量谱测量酸是一种酸.蛋白质 蛋白质 蛋白质蛋白质组学是指蛋白质组学.实时RT-PCR实时RT-PCR的时间这就是SARS-CoV-2病毒.这是唾液的唾液.文字转录学 (Transcriptomics) 是一个学科.更多相关视频
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