机器学习区分P2X7介导的细胞内火花在人类诱导的多能干细胞衍生的神经干细胞中
Yuki Hanafusa1,2, Akira Shiraishi3, Fumiyuki Hattori4
1Innovative Regenerative Medicine, Graduate School of Medicine, Kansai Medical University, Osaka, Japan.
Scientific reports
|August 4, 2023
概括
人类诱导的多能干细胞衍生的神经干细胞 (iNSCs) 通过P2X7受体感知腺三酸盐 (ATP). 一个机器学习模型根据iNSC反应准确地识别出食物中产生的神经活性物质.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 干细胞生物学 干细胞生物学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 腺三酸盐 (ATP) 作为一种细胞外信号分子,影响生理和病理生理状态.
- purinergic受体,特别是离子变异性P2X7受体,调解ATP信号传递.
- 神经干细胞 (NSC) 存在于成人的组织中,并参与生理过程,对病理条件作出反应.
研究的目的:
- 研究人类诱导的多能干细胞干细胞衍生的NSCs (iNSCs) 的ATP感应能力.
- 开发一种基于机器学习 (ML) 的系统,用于选食品中产生的神经活性物质及其有效剂量.
- 分析iNSCs中的ATP触发的反应.
主要方法:
- 通过P2X7受体对iNSCs的ATP感应能力的表征.
- 从与各种物质和剂量预处理的iNSC中收集ATP触发的反应.
- 使用九个波形图像的复合图像来提高精度的ML模型的开发.
主要成果:
- iNSCs主要通过P2X7受体表现出ATP感应.
- 开发的ML模型准确地分类了由不同物质和剂量引起的微妙波形变化.
- 该ML模型确定了与特定基因本体学特征相关的常见mRNA表达变化.
结论:
- iNSCs具有由P2X7受体介导的功能性ATP感应机制.
- 一个基于ML的新查系统可以有效地识别食物来源中的神经活性化合物.
- 这种方法有助于发现影响神经干细胞功能和基因表达的物质.
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