多样性条纹体的基因表达遗传学 杂交小鼠 杂交小鼠
Vivek M Philip1, Hao He2, Michael C Saul1
1The Jackson Laboratory for Mammalian Genetics, Bar Harbor, ME, 04605, USA.
Scientific data
|August 5, 2023
概括
遗传变异影响大脑基因表达,影响诸如上之类的行为. 这项研究绘制了小鼠条形体中的表达量性特征位点 (eQTLs),创造了一个资源,将遗传变异与转录水平和行为联系起来.
科学领域:
- 神经遗传学 神经遗传学
- 行为遗传学 行为遗传学
- 系统神经科学 系统神经科学
背景情况:
- 大脑转录变异是一种遗传性特征,影响复杂的行为,如成.
- 表达量的特征位置 (eQTL) 映射识别了具有影响转录丰度的遗传变异的基因组区域.
研究的目的:
- 为了对鼠标条形体中的转录丰富性进行分析,并执行eQTL映射.
- 在GeneWeaver中开发基于浏览器的eQTL查看器和存储协同表达网络数据.
- 为将遗传变异与差异表达的转录和与成相关的行为联系起来提供数据资源.
主要方法:
- 来自386只多样性异种 (J:DO) 老鼠 (两性) 的条状组织的RNA测序.
- 使用探索性和冒险性测试进行行为特征.
- eQTL映射,开发基于浏览器的eQTL查看器,并在GeneWeaver.com中存储数据.
主要成果:
- 在小鼠条体中对转录丰富性的全面分析.
- 识别与转录丰度变异相关的基因组区域.
- 开发用于数据探索和多种类比较的工具 (eQTL查看器,GeneWeaver).
结论:
- 开发的数据资源使研究人员能够识别调节转录水平的遗传变异.
- 用户可以探索这些变异的功能上下文,与条状基因表达和与成有关的行为有关.
- 这项工作有助于更深入地了解复杂行为的遗传基础.
