大酶的表达模式预测免疫疗法反应,并确定CD8+ T细胞子集的异质性
Jing Li1, Huibo Zhang1,2, Jie Wu1
1Cancer Center, Renmin Hospital of Wuhan University, Wuhan, Hubei, China.
Cancer biomarkers : section A of Disease markers
|August 7, 2023
概括
大酶 (GZM) 基因变异影响癌症免疫疗法反应. 一个GZM得分预测了生存和免疫治疗结果,突出了GZMs作为各种癌症的潜在生物标志物.
科学领域:
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 在瘤学瘤学.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 大酶 (GZM) 基因变异越来越多地被认为对癌症免疫疗法的有效性有影响.
- 了解GZM表达模式对于预测患者对治疗的反应至关重要.
研究的目的:
- 在免疫治疗的背景下,系统地分析各种癌症中GZM的表达和预后价值.
- 根据GZM表达和它们的功能异质性来识别不同的CD8+T细胞子集.
主要方法:
- 全癌症分析GZM表达和预后意义.
- 使用ssGSEA开发一个GZM得分来量化GZM路径丰富.
- 使用TIDE和IPS算法评估GZM得分对生存和免疫治疗反应的预测值.
- 使用CellChat,scMetabolism和SCENIC对与GZM相关的CD8+T细胞子集进行了深入分析.
主要成果:
- GZM得分与IPS和TIDE得分有显著的关联,与黑色素瘤和泌尿腺癌的免疫治疗反应率相关.
- 基于GZM表达的CD8+T细胞子集在肺腺癌 (LUAD) 中表现出功能,代谢和细胞间通信异质性.
- 转录因子RUNX3和ETS1与组织内存T细胞标记物正相关,这表明在GZM表达中起着调节作用.
结论:
- 较高的GZM得分可以预测黑色素瘤和尿癌的免疫治疗反应和生存率,但细胞癌 (RCC) 的生存率可能更差.
- GZM得分作为多种癌症类型的潜在预后生物标志物.
- RUNX3和ETS1被确定为调节GZM表达的CD8+T细胞透和组织内存程序的潜在目标,影响预后和免疫治疗反应.
