TRB CDR3-癌症丸抗原化学互补评分用于识别细胞癌中生产性免疫反应
Tabitha R Hudock1, Vayda R Barker1, Brandon J Manley2
1Department of Molecular Medicine, Morsani College of Medicine, University of South Florida, Tampa, FL, USA.
Cancer biomarkers : section A of Disease markers
|August 7, 2023
概括
对T细胞受体β (TRB) 补充性确定区域-3 (CDR3) 氨基酸序列和癌抗原 (CTAs) 的化学互补性评分可以预测细胞癌 (RCC) 患者的更好的生存率. 较高的分数与免疫标记基因的表达增加有关.
科学领域:
- 免疫基因组学是什么
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 细胞癌 (RCC) 免疫基因组学揭示了免疫功能障碍,但特定的瘤微环境相互作用仍然不清楚.
- 了解免疫细胞相互作用对于RCC治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 研究TRB CDR3氨基酸序列的化学互补评分与癌症丸抗原 (CTA) 之间的相关性.
- 评估这种互补性是否会影响RCC.中的患者存活率和免疫标记基因表达.
主要方法:
- 来自RCC瘤样本的TRB重组读数从莫菲特癌症中心和癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库中分析.
- 化学互补评分 (CSs) 为TRB CDR3-CTA对进行计算.
- 根据计算的CS进行了生存评估.
主要成果:
- 对TRB CDR3和CTA POTEA的更高化学CS与Moffitt和TCGA队列中的更好的整体存活率 (OS) 有关.
- 免疫特征基因 (granzyme A,granzyme B,干扰素-) 的瘤RNA表达增加与更高的化学CSs相关.
结论:
- 通过TRB CDR3-CTA化学互补性评分,有可能区分RCC病例与具有生产力的抗瘤免疫反应.
- 这种评分方法可以提供有关免疫反应有效性的见解,在基本评估不一致的情况下.
更多相关视频
15:17Colorectal Cancer Cell Surface Protein Profiling Using an Antibody Microarray and Fluorescence Multiplexing
Published on: September 25, 2011
14.0K
14:14Simultaneous Quantification of T-Cell Receptor Excision Circles TRECs and K-Deleting Recombination Excision Circles KRECs by Real-time PCR
Published on: December 6, 2014
16.7K