用高通量选系统选的 β-转化素重复含有的蛋白质配体的分离和特征
Xintong Liu1,2,3, Emiko Sanada1,3,4, Jiang Li5
1Chemical Resource Development Research Unit, RIKEN CSRS, Wako, Saitama, 351-0198, Japan.
Oncology research
|August 7, 2023
概括
研究人员开发了一种高通量选系统,以识别β-转化素重复含有蛋白 (β-TrCP) 的小分子配体. 发现一些化合物抑制细胞中的β-TrCP活性,影响NF-κB信号传递.
科学领域:
- 生物化学和分子生物学
- 药物发现和开发 药物发现和开发
背景情况:
- β-转化素重复含有蛋白 (β-TrCP) 是SCF E3无酸酶复合物的关键组成部分,决定了基质的特异性.
- 向β-TrCP对开发新型治疗策略有兴趣,包括向蛋白质分解的嵌合体 (PROTACs).
研究的目的:
- 开发一种高通量选 (HTS) 系统,用于识别β-TrCP的小分子配体.
- 发现强大的β-TrCP配体,以便在未来在PROTAC技术中应用.
- 研究已识别的β-TrCP抑制剂的作用机制和关键结构特征.
主要方法:
- 开发和实施HTS系统,以选β-TrCP配体的化学库.
- 在体外测试中,对被击中化合物对SCFβ-TrCP1泛化活性的影响进行了评估.
- 针对性化合物对TNFα诱导的IκBα降解和细胞中NF-κB转录活性的影响的评估.
- 在分析中,确定负责β-TrCP结合的关键功能组.
主要成果:
- 确定了几个受影响的化合物,包括NPD5943,NPL62020-01和NPL42040-01.
- 这些化合物有效地抑制了TNFα诱导的IκBα及其酸化形式的降解,从而抑制了NF-κB的激活.
- 在分析中发现,被击中化合物中的碳基和基组与β-TrCP形成键,模仿与天然脂基质的相互作用.
结论:
- 该研究成功建立了一个HTS系统,用于发现β-TrCP配体.
- 已识别的小分子在细胞环境中表现出强大的β-TrCP活性抑制.
- 这些发现为 β-TrCP 配体设计的结构要求提供了宝贵的见解,这对 PROTAC 开发至关重要.
