在儿童群体的便样本中使用下一代测序对Helicobacter pylori抗菌耐药性的测序
Silvana Bonilla1, Jeffrey Goldsmith1, Paul Mitchell2
1From the Division of Pediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition, Harvard Medical School and Boston Children's Hospital, Boston, MA.
Journal of pediatric gastroenterology and nutrition
|August 7, 2023
概括
下一代测序 (NGS) 便测试显示了指导Helicobacter pylori (H pylori) 治疗的高准确性. 这种非侵入性方法提供了快速的抗微生物敏感性结果,有助于有效的H pylori根除策略.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 儿童传染病 儿童传染病
背景情况:
- 全球范围内Helicobacter pylori根除率的下降需要改进的诊断方法.
- 抗菌敏感性测试 (AST) 对于定制H pylori治疗方案至关重要.
- 下一代测序 (NGS) 为快速的AST提供了一个有希望的非侵入性方法.
研究的目的:
- 评估基于便的新型NGS分析对H pylori抗菌素敏感性的一致性与黄金标准.
- 评估便NGS的诊断性能,以检测儿科患者对关键的H pylori抗生素的耐药性.
主要方法:
- 一种基于便的新型NGS分析被开发用于H pylori AST.
- 便NGS的结果与传统的胃活检培养通过阿加稀释进行了比较.
- 该研究包括20名儿科患者,在胃活检中确认了H pylori.
主要成果:
- 便NGS表现出与阿加稀释剂的高度一致性,没有耐药性 (100%),清素 (100%),阿莫西西林 (100%) 和勒沃素 (67%) 的耐药性.
- 在这个队列中,没有达到对美特龙醇耐药性的一致性.
- 在H pylori敏感性测试中,NGS方法被证明是有效和快速的.
结论:
- 基于便的NGS是一种高度一致和潜在的有价值的非侵入性工具,用于小儿患者的H pylori抗菌素敏感性测试.
- 需要在更大,更多样化的群体中进行进一步的验证,以确认其实用性,特别是在对美特龙醇耐药性的治疗中.
- 这种分子方法可以显著帮助优化H pylori治疗策略.
