基于无标签的蛋白质组学,鉴定了因窒息而导致老鼠死亡的心脏中差异表达的蛋白质
Zhe Zheng1, Li Zhang2, Congcong Zhao3
1Department of Basic Medicine and Forensic Medicine, Henan University of Science and Technology, Luoyang, Henan 471023, China; Department of Forensic Medicine, Faculty of Basic Medical Sciences, Chongqing Medical University, Chongqing 400016, China.
Legal medicine (Tokyo, Japan)
|August 7, 2023
概括
在没有明显伤害的情况下识别机械窒息死亡是具有挑战性的. 这项研究发现了特定的心脏蛋白质,可以作为窒息死亡的分子标记,帮助法医调查.
科学领域:
- 法医医学 法医医学
- 分子生物学分子生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
背景情况:
- 在缺乏外伤的机械窒息病例中确定死因对法医提出了重大挑战.
- 需要分子生物标记来准确识别因窒息而导致的死亡.
研究的目的:
- 在心脏中识别新的分子生物标记,以预测机械窒息 (窒息) 导致的死亡.
主要方法:
- 建立了一种小鼠窒息模式.
- 使用无标签蛋白质组技术分析心脏组织中的蛋白质表达.
- 使用折叠变化和Q值标准识别了差异表达蛋白 (DEP).
- 生物信息学分析 (MCODE) 用于途径分析.
- 选择的蛋白质使用并行反应监测 (PRM) 和免疫组织化学验证.
主要成果:
- 总共量化了3307种蛋白质,确定了606种DEP (219种上调,387种下调).
- 候选蛋白主要涉及于核糖体功能,心肌收缩,调节,凝血和线粒体呼吸.
- 七种蛋白质,包括纤维素α链 (FIBA),纤维素gamma链 (FIBG) 和calsequestrin-2 (CASQ2),得到了验证.
- 通过免疫组织化学进一步证实了CASQ2和FIBG.
结论:
- 该研究确定了心脏中的几个差异表达的蛋白质,这些蛋白质显示出机械窒息死亡的潜在辅助诊断指数.
- 这些分子标记物可能有助于法医病理学家在没有外部迹象的窒息的情况下.
