在生活方式干预中确定基于微生物组的分层的强大和可泛化的生物标志物
Jiarui Chen1,2,3, Sara Leal Siliceo1, Yueqiong Ni1
1Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology, Hans Knöll Institute -Microbiome Dynamics, Jena, Germany.
Microbiome
|August 8, 2023
概括
肠道微生物干预结果因个体差异而变化. 这项研究确定了影响肠道微生物群耐药性的特定细菌和代谢途径,并开发了一个模型来预测个人对生活方式变化的反应.
科学领域:
- 人类微生物组研究研究
- 转基因组学是指转基因组学.
- 个性化医疗是个性化的医疗.
背景情况:
- 肠道微生物群显著影响人类健康.
- 像饮食和运动这样的微生物组导向干预措施对改善健康有希望.
- 个体肠道微生物群的多样性导致对生活方式变化的反应变化.
研究的目的:
- 为了确定肠道微生物群对结构变化的耐药性的生物标志物.
- 了解微生物组动态的调节者.
- 为个人对生活方式干预措施的反应开发预测模型.
主要方法:
- 来自396个人的1448个猎枪甲基因组学样本的大规模元分析.
- 在生活方式干预研究中的纵向数据分析.
- 机器学习模型开发用于预测"响应者"和"非响应者".
主要成果:
- 鉴定出 *Bacteroides stercoris*, *Prevotella copri* 和 *Bacteroides vulgatus* 作为微生物群耐药性的生物标志物.
- 芳香和非芳香氨基酸生物合成被确定为微生物组动态的关键调节者.
- 开发了一个具有0.86的AUC的预测模型,用于在不同的队列中对应者进行分类.
结论:
- 基于微生物组的分层可以识别具有高度可塑性或耐药性微生物结构的个体.
- 识别不响应者对于临床研究的成功至关重要.
- 这种方法可以为肠道微生物群重组提供量身定制的治疗干预措施.
