QM/MM 建模辅助的酶工程在自然产品生物合成中的生物合成
Fan Zhang1,2, Tao Zeng2, Ruibo Wu2
1Guangdong Provincial Key Laboratory of Translational Cancer Research of Chinese Medicines, Joint International Research Laboratory of Translational Cancer Research of Chinese Medicines, International Institute for Translational Chinese Medicine, School of Pharmaceutical Sciences, Guangzhou University of Chinese Medicine, Guangzhou 510006, P. R. China.
Journal of chemical information and modeling
|August 9, 2023
概括
量子力学/分子力学 (QM/MM) 计算方法加速了自然产品生物合成的工程. 这次审查强调了QM/MM.
科学领域:
- 生物化学和生物技术
- 计算化学计算化学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 天然产品在制药中至关重要,但需求超过供应.
- 工程生物合成为天然产品生产提供了一个可持续的替代方案.
- 酶工程对于优化生物催化剂至关重要,但需要先进的工具.
研究的目的:
- 审查QM/MM对酶催化物的计算研究的最新进展.
- 探索QM/MM在天然产品生物合成的酶工程中的应用.
- 讨论这个领域的未来挑战和前景.
主要方法:
- 量子力学/分子力学 (QM/MM) 的计算模拟.
- 对酶催化机制的分析.
- 有理性的酶工程策略.
主要成果:
- QM/MM已经成为了解酶机制的强大工具.
- QM/MM有助于酶的合理设计,以提高催化效率.
- 在将QM/MM应用于天然产品生物合成方面取得了重大进展.
结论:
- QM/MM在推进天然产品合成的酶工程方面发挥了重要作用.
- 进一步开发QM/MM方法将增强生物催化剂和药物发现.
- 结合计算和实验的跨学科方法是未来成功的关键.
