开发和验证基于深度学习的m6修改模型,用于预测细胞癌的临床预后
Siteng Chen1, Encheng Zhang2, Tuanjie Guo2
1Department of Urology, Renji Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Shanghai, China.
Journal of cancer research and clinical oncology
|August 9, 2023
概括
我们开发了一个深度学习模型,使用m6A修饰数据来预测细胞癌 (RCC) 的预后. METTL14缺乏促进RCC细胞迁移和增殖,这表明一个潜在的治疗点.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 没有以前的m6A修改模型用于细胞癌 (RCC) 预后预测使用深度学习.
- 甲基转移酶样14 (METTL14) 在RCC中的作用仍未得到充分研究.
研究的目的:
- 开发和验证基于深度学习的m6A修改模型,用于预测RCC患者的预后.
- 调查METTL14在RCC进展中的作用.
主要方法:
- 利用深度学习算法构建一个m6A预后模型.
- 为了实验验证,采用了西部涂抹,qPCR,免疫组织化学和RNA免疫沉.
主要成果:
- 深度学习模型准确地预测了RCC患者在多个队列中的5年生存状态.
- 发现METTL14缺乏会增强癌细胞的迁移和增殖.
- 在RCC的背景下,METTL14可能会调节circRNA.
结论:
- 一个新的基于深度学习的m6A预后模型成功开发和验证了RCC.
- METTL14缺乏促进RCC细胞迁移和增殖,表明其作为癌症预防治疗点的潜力.
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