使用微卫星标记物评估阿尔及利亚本土子种群的遗传多样性
Abdelbaki Bouhali1,2, Abdelkader Homrani1, Nuno Ferrand3,4
1Laboratory of Sciences and Technics for Animal Production (LSTAP), Department of Agronomic Sciences, Faculty of Nature Sciences and Life, Abdelhamid Ibn Badis Mostaganem University, Mostaganem, Algeria.
Archives animal breeding
|August 10, 2023
概括
当地的阿尔及利亚子表现出显著的遗传多样性,南部种群显示出更高的适应性. 这项研究为这些有价值的农场动物遗传资源 (FAGR) 的保护策略提供了信息.
科学领域:
- 动物遗传学动物遗传学
- 保护生物学 保护生物学
- 人口遗传学 人口遗传学
背景情况:
- 当地的农场动物遗传资源 (FAGR) 是至关重要的,但由于杂交而受到威胁.
- 原住民阿尔及利亚子 (NARs) 适应了农村环境中的非生物压力.
- 了解NAR遗传多样性对于它们的保护至关重要.
研究的目的:
- 评估阿尔及利亚土著子 (NARs) 的遗传多样性.
- 识别不同地理区域的遗传变异模式.
- 为保护和繁殖改进计划提供数据.
主要方法:
- 在阿尔及利亚七个地区的25个地理点进行微卫星位置分析 (85个位置).
- 计算遗传多样性指数,包括等位基因数,异构性和近亲繁殖系数.
- 使用主要组件的差别分析 (DAPC),邻居连接 (NJ) 树和STRUCTURE软件进行人口结构分析.
主要成果:
- 观察到高遗传多样性,南部人口显示最高水平.
- 拉古瓦特地区呈现出每位基因基因的平均数量 (MNa) 和近亲繁殖系数最高.
- 观察到的异构性 (0.427) 低于预期的 (0.524),表明了近亲繁殖.
- 确定了四个不同的基因集群,与地理区域 (东,西,南,中) 相应.
结论:
- 阿尔及利亚本土子具有显著的遗传多样性,特别是在南部地区.
- 亲生繁殖是一个问题,需要有针对性的保护工作.
- 遗传多样性的地理结构支持NAR的量身定制的育种和保护策略.
