不同RT-PCR套件的性能评估,用于在预热样本中直接检测SARS-CoV-2
Rajeev Kumar Jain1, Nagaraj Perumal1, Deepti Chaurasia2
1State Virology Laboratory, Gandhi Medical College, Bhopal, Madhya Pradesh, India.
Journal of laboratory physicians
|August 11, 2023
概括
没有核酸提取的直接实时聚合酶链反应 (RT-PCR) 提供了更快,更具成本效益的严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 检测. 三个套件 (TaqPath,COVIDsure Pro,Hi-PCR) 显示出有效性,COVIDsure Pro在低病毒载量场景中表现出色.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 病毒学 病毒学
- 临床诊断 临床诊断 临床诊断
背景情况:
- 由于COVID-19的流行,需要快速且可扩展的诊断解决方案.
- 在对SARS-CoV-2进行RT-PCR检测之前,传统的核酸提取是耗时且昂贵的.
- 直接RT-PCR方法为高通量查提供了潜在的优势.
研究的目的:
- 评估四个商业SARS-CoV-2RT-PCR套件的分析性能,使用没有核酸提取的直接方法.
- 评估使用预热样本直接RT-PCR检测SARS-CoV-2在不同病毒载量的有效性.
主要方法:
- 100个临床标本被分为高病毒载量 (Ct < 30),低病毒载量 (Ct > 30) 和负组.
- 标本经过热无活化 (70°C10分钟),然后冷却 (4°C).
- 通过使用标准和直接的RT-PCR协议测试了四种套件 (ViralDtect-II,TaqPath COVID-19 Combo,COVIDsure Pro,Hi-PCR Coronavirus).这些套件使用标准和直接的RT-PCR协议进行测试.
主要成果:
- 三个套件TaqPath COVID-19 Combo,COVIDsure Pro和Hi-PCR Coronavirus使用直接RT-PCR方法成功放大了所有SARS-CoV-2基因.
- 这三个套件对具有高病毒载荷 (I组) 的标本实现了100%的灵敏度.
- COVIDsure Pro套件在检测低病毒载量 (II组) 的标本方面表现出卓越的性能.
结论:
- 没有核酸提取的直接RT-PCR是流行病期间检测SARS-CoV-2的有价值和具有成本效益的策略.
- 塔克帕特COVID-19组合,COVIDsure Pro和Hi-PCR冠状病毒套件适用于直接的RT-PCR应用.
- "COVIDsure Pro"套件表现出最好的整体性能,特别是在病毒载量较低的样本中.
