对高度多重化的组织成像数据分析中的深度学习应用进行审查
Mohammed Zidane1, Ahmad Makky1, Matthias Bruhns2,3
1Department of Pathology and Neuropathology, University Hospital and Comprehensive Cancer Center Tübingen, Tübingen, Germany.
Frontiers in bioinformatics
|August 11, 2023
概括
深度学习 (DL) 与空间奥米克结合,通过分析复杂的生物数据来增强瘤学研究. 这种整合改善了癌症预后和治疗预测,比传统方法提供了更深入的机械洞察力.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 深度学习 (DL) 对瘤学产生了重大影响,有助于使用各种生物数据进行临床发现和生物标志物预测.
- DL算法分析基因组学,蛋白质组学和成像数据,预测遗传变异效应和蛋白质结构.
- 空间奥米克技术,如空间转录和蛋白质组学,提供机械生物学见解.
研究的目的:
- 审查人工智能 (AI) 的影响,特别是DL,与瘤学中的空间omics技术相结合.
- 专注于用于瘤学的生物医学图像分析中的DL应用,包括细胞细分,表型识别,预后和治疗预测.
- 突出高度多重复合图像的优点,而不是传统的遗传病理图像,以深入的机械洞察力.
主要方法:
- 在瘤学中分析空间空间数据中的DL应用的审查.
- 将高度多重化的图像 (空间蛋白质组学) 与传统的基因病学图像进行比较.
- 基于DL的管道的评估,用于预处理高度多重化的图像 (细胞细分,细胞类型注释).
主要成果:
- DL与空间奥米克相结合,提供了传统成像无法获得的深度机械洞察力,即使是可解释的AI.
- 基于DL的管道为预处理高度多重化的图像提供了优点和缺点,有助于管道选择.
- DL对于使用高度多重化的组织成像数据发现新生物机制至关重要.
结论:
- 当与空间奥米克技术相结合时,DL是发现生物机制的重要工具.
- 在临床常规中DL的作用正在增长,支持瘤诊断,预后和决策.
- 将DL与先进的成像技术相结合,有望提高瘤学中的患者护理质量.


