血素和氨酸染色有助于减少短时间的母体污染 双重重复基因定型用于水性形分子诊断

科学领域:

• 生殖医学 生殖医学
• 分子诊断学 分子诊断
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 短串联重复 (STR) 基因型定型对于诊断积体和水性形分子至关重要.
• 甲固定嵌 (FFPE) 组织对母体DNA的污染是STR基因定型的一个常见挑战.
• 传统的未染色部分容易受到污染问题.

研究的目的:

• 评估血素和欧 (H&E) 染色对DNA质量和STR基因型定型准确性的影响.
• 为了确定H&E染色是否可以减轻FFPE样本中的母体污染,以诊断水性形.

主要方法:

• 从未染色,脱化水合和H&E染色的FFPE胎盘组织段中提取DNA.
• 在三个组中分析了DNA质量,聚合酶连锁反应放大效率和STR基因造型.
• 分析包括一个测试队列 (n=6) 和一个验证队列 (n=149).

主要成果:

• H&E染色不会影响DNA质量或FFPE组织的分子测试.
• 用H&E染色的部分提供了更清晰的宏观切割视野.
• 在测试队列中,只有H&E染色的部分没有显示母亲污染峰值.
• 验证队列显示了92.62%的令人满意的放大结果,没有母体污染使用H&E染色部分.

结论:

• H&E染色与从FFPE组织中提取DNA和STR基因定型是兼容的.
• 在STR基因定型中,H&E染色显著降低了对母体的污染.
• 用H&E染色的截面适合整合到水性形的分子诊断工作流程中.