瑞士血管生物库:评估最佳提取方法和入院解决方案,以保护人类血管组织中的RNA

科学领域:

• 生物技术是生物技术.
• 分子生物学分子生物学
• 这是生物银行.

背景情况:

• 下一代测序的可靠数据需要适当的生物银行.
• 患有动脉样硬化病理的患病血管组织由于RNA质量低而存在挑战.

研究的目的:

• 评估RNA分离方法和保存解决方案用于血管生物银行.
• 在患病与健康的血管组织中评估RNA完整性和基因表达.

主要方法:

• 从腹部大动脉动脉瘤 (AAA),外周动脉疾病 (PAD),健康的大动脉 (HA) 和肌肉样本中分离RNA.
• 评估RNA完整数 (RINs) 和基因表达 (家政,核糖体和lncRNAs).
• 结冷保护溶液与 RNA 的比较,后者用于组织保存.

主要成果:

• 患病的血管组织产生了低RNA完整性数 (RINs) 的2-4.
• 低温保护溶液在保护组织以进行初级细胞隔离方面优于RNAlater.
• 18S和28S核糖体RNA的降解与患病样本中的低RIN相关.

结论:

• 对于生物库中初级细胞隔离,冷保护性溶液比RNA更好.
• 随机RNA降解需要与相似的RIN进行控制,以避免误解基因表达数据.
• DV200是比RIN更可靠的衡量标准,用于选择用于OMIC分析的样本,因为它代表了整体RNA分解.