癌症相关的纤维细胞影响膜间皮瘤的存活率:数字基因表达分析和监督机器学习模型
Sabrina Borchert1, Alexander Mathilakathu1, Alina Nath1
1Institute of Pathology, University Hospital Essen, University of Duisburg Essen, 45147 Essen, Germany.
International journal of molecular sciences
|August 12, 2023
概括
腹间隔膜瘤 (PM) 中的脱质体反应 (DSR) 与延长存活率有关,特别是当与纤维细胞激活蛋白α (FAP) 基因表达相关时. 这一发现为PM患者提供了潜在的预后生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 癌症生物学 癌症生物学
- 分子病理学分子病理学
背景情况:
- 瘤进展中的脱质层反应 (DSR) 机制尚不清楚.
- 流体变化被认为是膜间皮瘤 (PM) 的不良预后指标.
- 癌症相关纤维细胞 (CAF) 和它们的信号传递显著影响瘤微环境.
研究的目的:
- 为了研究CAFs的近信号传递和DSR对肺部间皮瘤患者存活率的影响.
- 在PM的瘤微环境中识别潜在的预后生物标志物.
主要方法:
- 对DSR和纤维细胞激活蛋白α (FAP) 的形态和免疫组织化学评估.
- 使用NanoString CodeSet.Set进行数字基因表达分析.
- 使用条件推理树 (CIT) 算法进行机器学习分析.
主要成果:
- 在FAP基因表达和DSR存在之间发现了显著的关联 (p=0.025).
- 患有高DSR的患者表现出明显延长的中位生存期.
- 增加的FAP,VEGFC和CDK4表达与延长的整体存活 (OS) 相关联.
- 相反,MYT1,KDR,PIK3R1,PIK3R4和SOS1的表达与缩短的OS有关.
- 在CIT分析中,发现了基于FAP,NF1和RPTOR表达的三层预后系统.
结论:
- 由CAFs诱导的PI3K信号传递和FAP依赖的CDK4细胞周期进展是PM的关键预后因素.
- 这项研究强调了FAP和DSR在多间皮瘤的预后价值.
- 迫切需要新的预后和预测生物标志物来指导PM的治疗策略.
