肝细胞癌的免疫细胞组成和生物年龄的解,使用DNA甲基化
Sidharth S Jain1, Megan E McNamara1, Rency S Varghese1
1Lombardi Comprehensive Cancer Center, Georgetown University Medical Center, Washington, DC, USA.
Methods (San Diego, Calif.)
|August 13, 2023
概括
肝细胞癌 (HCC) 显示自然杀手 (NK) 细胞丰度下降,与细胞衰老和表观遗传衰老的增加有关. 这些发现表明,在HCC中,免疫疗法反应的潜在生物标志物.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 自2017年以来,免疫疗法已被批准用于肝细胞癌 (HCC),但反应生物标志物有限.
- 描述瘤免疫微环境对于分类HCC和识别预测生物标志物至关重要.
- 了解免疫细胞和瘤特征之间的相互作用可以改善治疗策略.
研究的目的:
- 通过使用DNA甲基化数据,研究HCC中的瘤免疫微环境组成.
- 为了确定HCC瘤和相邻的正常组织之间的免疫细胞群的差异.
- 探索细胞衰老,表观遗传衰老和免疫细胞透在HCC中的关系.
主要方法:
- 将细胞类型解卷算法应用于DNA甲基化阵列数据.
- 分析了公开可用的和内部的HCC数据集 (57名患者).
- 利用DNA甲基化"钟"来估计表型衰老,并与细胞衰老标志物进行比较.
主要成果:
- 与正常组织相比,NK细胞的丰度在HCC瘤中显著下降.
- 细胞衰老和表观遗传衰老在HCC瘤中显著增加.
- 增加年龄加速和衰老与减少NK细胞丰度有很强的相关性.
结论:
- 在HCC瘤微环境中,NK细胞的透减少.
- 这种NK细胞的损失与瘤衰老的增加和与年龄相关的表型有关.
- 这些发现突出了NK细胞与衰老的微环境之间的相互作用,提供了潜在的HCC生物标志物.
