在中国老年重症监护病房使用mNGS进行微生物群体表征和分子耐药性监测
Jilin Yang1, Lingyi Li2, Xiaolin Zhu1
1Department of Critical Care Medicine, The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University, Kunming, People's Republic of China.
Infection and drug resistance
|August 14, 2023
概括
在ICU的表面病原体威胁到老年患者. 甲基因组测序揭示了经常接触的表面上具有高致病原体和耐药性基因的丰富性,突出显示mNGS是关键的监控工具.
科学领域:
- 环境微生物学环境微生物学
- 在医院获得的感染.
- 基因组学和测序技术.
背景情况:
- 重症监护室 (ICU) 的表面病原体对全球健康构成风险,特别是在免疫力低下的老年人身上.
- 下一代元基因组测序 (mNGS) 为环境微生物监测提供了一个公正的方法.
研究的目的:
- 在六个月的时间里,研究中国老年病房ICU中的微生物群落.
- 在环境样本中分析病原体概况和耐药性基因,并将其与患者培养物进行比较.
- 评估mNGS在医院环境监测中的实用性.
主要方法:
- 一项为期六个月的研究 (2022年1月至7月) 在老年人重症监护室.
- 在每三个月间隔使用mNGS定期监测多个表面.
- 在环境和患者样本之间比较病原体和耐药性基因资料.
主要成果:
- 微生物组成随时间变化而稳定,但在不同的表面上有显著的变化.
- 高接触面上存在病原性微生物,包括*Acinetobacter baumannii* (CRAB),*Pseudomonas aeruginosa*和*Enterococcus faecium*.这些微生物是病原性的.
- mNGS检测到病毒,真菌和寄生虫;在大多数环境样本中发现了丰富的耐药基因.
结论:
- 在ICU的微生物组成保持不变,地板显示最高的多样性和丰富性.
- 在ICU环境中的耐药基因可能会转移到患者身上.
- mNGS是一个强大的新兴工具,用于医院环境的微生物监测.
