一个简单,快速和部分自动化的协议,用于从冷哺乳动物组织中分离单核,用于单核测序

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 生物技术是生物技术.

背景情况:

• 单细胞和单核RNA测序 (scRNA-seq和snRNA-seq) 是转录组分析的强大工具.
• 对于分析具有挑战性的组织中的基因表达和利用档案冷样本,snRNA-seq特别有价值.

研究的目的:

• 为 snRNA-seq.描述一种用于从冷哺乳动物组织中分离高质量的单核的协议.
• 用商业可用的仪器和试剂演示部分自动化工作流程.

主要方法:

• 使用机器人解离器进行自动组织均质化.
• 通过优化的化学梯度过来隔离核.
• 通过光细胞计数器自动计数核.

主要成果:

• 该协议成功地从冷的老鼠大脑,老鼠脏和Cynomolgus肝脏和脏中分离出高质量的单核.
• 该方法是高效的,快速的,并适应各种哺乳动物组织.
• 该过程部分自动化,提高了标准化和可重复性.

结论:

• 该协议提供了一种简单有效的方法,用于为snRNA-seq.制备冷组织中的单个核.
• 部分自动化方法简化和标准化核隔离,使其可用于更广泛的研究应用.
• 该协议产生了优质的核,适合下游转录基因分析.