在体内研究Mycobacterium avium亚种. 肺结核微演变和混合菌株感染
Alexander Byrne1, Nathalie Bissonnette2, Séverine Ollier2
1Department of Biology, Memorial University of Newfoundland , St. John's, Newfoundland and Labrador, Canada.
Microbiology spectrum
|August 16, 2023
概括
混合菌株感染和微演变在约翰氏病中很常见,这种疾病是由Mycobacterium avium亚种引起的. 部分结核病 (MAP). 在MAP中特定的短序重复 (SSR) 的变化会影响蛋白质产品,可能会影响感染力和宿主免疫反应.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 兽医医学 兽医医学 兽医医学
背景情况:
- 约翰氏病 (JD),是由Mycobacterium avium亚种引起的. 甲状腺结核病 (MAP),导致全球乳制品行业的重大经济损失.
- 众所周知,混合菌株感染 (MSI) 和宿主内微演变会影响病原体动态,但在JD中尚未研究.
- MAP是一种增长缓慢的细菌,基因组进化速率低,但其适应机制需要进一步研究.
研究的目的:
- 调查混合菌株感染 (MSI) 的流行率和影响,以及来自受JD影响的反动物的MAP分离物中的微演变.
- 描述MAP菌株内的遗传变异,重点关注短序重复 (SSR) 和它们的潜在功能后果.
- 探索这些遗传变异对MAP感染性和宿主-病原体相互作用的影响.
主要方法:
- 来自14只受高分泌联合疾病影响的动物的最多10个MAP分离物的全基因组测序.
- 对单核酸多态 (SNP) 和短序重复 (SSR) 的分析,以识别分离物体内和之间的遗传多样性.
- 对受SSR变异影响的基因的蛋白质结构和功能的in silico预测.
主要成果:
- 在14只被检查的动物中,有12只发现了MSI和微观进化的证据.
- 短序重复SSR1和SSR2表现出高多样性和同位素,影响ORF1和ORF2的遗传读取框架.
- 在SSR1和SSR2的变化导致蛋白质序列和结构的改变,ORF1可能参与宿主免疫调节.
结论:
- MSI和微进化在MAP感染中很普遍,有助于宿主体内的遗传多样性.
- 在MAP中可变的SSR,特别是SSR1和SSR2,代表了快速适应和表型多样化的关键机制.
- 这些发现表明MAP克服宿主反应的潜在机制,这对疾病控制和了解MAP的传染性有意义.
