周围血液单核细胞的全基因组DNA甲基化和转录组表达特征在患有系统性硬化症与间歇性肺部疾病的患者中
Yanli Xie1, Hongjun Zhao2, Hui Luo2
1Department of Rheumatology, Xiangya Hospital, Central South University, Changsha 410008, China. xieyanli@csu.edu.cn.
概括
带有间歇性肺病的全身性硬化症在外周血液单核细胞中显示出明显的DNA甲基化和基因表达特征. 升级的Wnt/β-catenin和chemokine信号通路可能会导致系统性硬化症的发病.
科学领域:
- 基因组学和分子生物学
- 免疫学和风湿病学
背景情况:
- 系统性硬化症 (SSc) 是一种以纤维化为特征的自身免疫性疾病,其主要并发症是间歇性肺病 (ILD).
- 了解SSc与ILD背后的分子机制对于开发向疗法至关重要.
研究的目的:
- 调查SSc和ILD患者的外周血液单核细胞 (PBMC) 中的全基因组DNA甲基化和转录组表达特征.
- 分析DNA甲基化的影响Wnt/β-catenin和化学信号通路在SSc与ILD.
主要方法:
- 从患有SSc (有和没有ILD) 和健康对照患者中收集了PBMC.
- 使用Illumina 450K芯片分析了全基因组DNA甲基化.
- 用Illumina HT-12 v4.0芯片进行了基因表达水平的分析.
主要成果:
- 在具有ILD的SSc和没有ILD亚组的SSc之间观察到DNA甲基化和基因表达的显著差异.
- 与对照组相比,SSc患者发现Wnt/β-catenin信号通路 (例如FZD1,MAPK9,SMAD2,TCF7L2,WNT5B) 中多个基因的低甲基化和上调调.
- 在SSc患者中也观察到基因的低甲基化和上调化 (例如ARRB1,CXCL10,CXCL16,FGR,NCF1C).
结论:
- 独特的DNA甲基化和转录组概况区分了具有ILD的SSc与没有ILD的SSc.
- 在PBMC中升级的Wnt/β-catenin和chemokine信号通路与SSc.的病变发生有关.
- 这些发现突出了SSc的潜在治疗目标,特别是在肺部受影响的患者中.
