对于ADP-ribosylated的联合气相分离策略
Taku Kasai1, Shiori Kuraoka1, Hideyuki Higashi1
1Center for Interdisciplinary Cardiovascular Sciences, Division of Cardiovascular Medicine, Department of Medicine, Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts 02115, United States.
Journal of the American Society for Mass Spectrometry
|August 17, 2023
概括
高场不对称波形离子运动谱法 (FAIMS) 与气相分化分离 (GPS) 相结合,显著提高了ADP-ribosylation (ADPr) 的识别. 这种先进的方法提高了ADPR的测序深度,用于全面的ADP-ribosylome分析.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物化学 生化学
- 分析化学 分析化学
背景情况:
- ADP-ribosylation (ADPr) 是一个关键的翻译后修饰.
- 目前的质谱法方法面临的局限性是输入低或基线蛋白质核糖化.
- 推进ADPR检测需要创新的蛋白质组技术.
研究的目的:
- 评估高场不对称波形离子流动性光谱法 (FAIMS) 在增强ADP-ribosylation (ADPr) 鉴定方面的有效性.
- 确定将FAIMS与传统气相分化分离 (GPS) 结合对测序深度的影响.
- 建立一种更敏感的ADP-ribosylome分析方法.
主要方法:
- 使用高场不对称波形离子运动谱仪 (FAIMS) 进行气相分离.
- 应用气相分化分离 (GPS) 用不同的补偿电压.
- 分析了从小鼠脏样本中丰富的ADP-ribosylated.
- 将FAIMS辅助的方法与传统的GPS单独进行比较.
主要成果:
- 基于FAIMS的策略显著增加了已识别的ADPR的数量.
- 联合FAIMS和GPS方法产生了790个高度可靠的ADPR,而单独使用GPS则为90.
- 一个简化的两注射FAIMS策略确定了402个ADPR,相当于234个蛋白质.
结论:
- FAIMS与GPS的整合代表了ADP-ribosylation研究的重大进展.
- 这种结合策略增强了ADP-ribosylome分析的深度和范围.
- 开发的方法为未来研究后翻译修改提供了有价值的工具.
