在中国湖州的坎皮洛巴克特菌分离体的基因组表征

科学领域:

• 食品传播病原体研究研究
• 微生物基因组学和耐药性
• 公共卫生微生物学

背景情况:

• 坎比洛巴克是一个重要的食源性病原体,导致严重的胃肠道疾病.
• 了解坎皮洛巴克特菌的遗传多样性和抗生素耐药性对于公共卫生至关重要.
• 禽类产品是坎皮洛巴克特菌感染的常见来源.

研究的目的:

• 在湖州从人类腹病例和生家禽中分离出来的坎皮洛巴克特菌株的特征.
• 调查这些隔离物中毒性和耐药性基因的流行情况.
• 分析Campylobacter jejuni和Campylobacter coli的遗传关系和抗生素耐药性概况.

主要方法:

• 从临床和食品样本中分离和识别坎皮洛巴克特菌株.
• 多部位序列类型化 (MLST) 用于基因分析.
• 通过基因组测序分析毒性和耐药性基因.
• 现型抗生素敏感性测试.
• 使用核心基因组单核酸多态 (SNP) 的基因组分析.

主要成果:

• 鉴定出13种坎皮洛巴克特 (11种C. jejuni,2种C. coli) 的分离物.
• 发现了12种不同的序列类型 (ST),其中包括一种新型ST.
• 所有C. jejuni菌株都具有tet(O) 和blaOXA耐药基因;大肠杆菌菌株携带多个耐药基因.
• 对纳利迪克酸,西普洛素和四环素观察到高耐药率 (92.3%).
• 遗传学分析表明,来自人类和食物来源的C. jejuni分离物之间没有密切的关系.

结论:

• 来自湖州的人类和食品来源的坎皮洛巴克特菌分离物表现出显著的遗传多样性和高水平的抗生素耐药性.
• 存在特异性耐药基因,如tet(O) 和blaOXA,有助于观察到的耐药性模式.
• 由于C. jejuni分离物之间缺乏密切的家族遗传关系,这表明它们在食物链或宿主中存在多个独立的引入.